基礎生醫專題
| 學期 | 課程名稱 | 學分 | 時數 | 開課教師 | 校區/系所 | 選別 |
| 上 | 分子細胞生物學概論 | 2 | 2 | 楊永正 | 陽明 生醫資訊所 | 必修 |
| 上 | 生物統計學 | 2 | 2 | 林逸芬 | 陽明 公衛所 | 選修 |
| 上 | 先天免疫反應在人類疾病的角色 | 2 | 2 | 陳斯婷 | 陽明 臨醫所 | 選修 |
| 上 | 微生物及免疫學(含實驗) | 3 | 2.4+ lab0.6 |
黃雪莉 | 陽明 微生物科 | 必修 |
| 下 | 高等微生物及免疫學通論-細菌學(碩) | 2 | 2 | 高正彥 | 陽明 微免所 | 必修 |
| 下 | 微生物生理及遺傳實驗 | 1 | 3 | 曾慶平 | 博愛 生物資訊及系統生物所 | 選修 |
| 下 | 分子細菌學(全英語) | 2 | 2 | 高正彥 | 陽明 微免所 | 選修 |
進階臨床專題
| 學期 | 課程名稱 | 學分 | 時數 | 開課教師 | 校區/系所 | 選別 |
| 上 | 菌- 腦 – 腸‘ 軸特論 | 2 | 2 | 盧俊良 | 陽明 腦科所 | 選修 |
| 上 | 生物微型檢測技術(全英語) | 3 | 3 | 李博仁 | 光復 生醫工程所 | 選修 |
| 上 | 微奈米製作技術與感測器 | 3 | 3 | 許鉦宗 | 光復 生醫工程所 | 選修 |
| 上 | 專題演講B-生資組 | 1 | 2 | 吳妍華 朱智瑋 |
博愛 生物資訊及系統生物所 | 選修 |
| 上 | 藥品微生物學：品保和品管 | 1 | 2 | 黃雪莉 | 陽明 微免所 | 選修 |
| 下 | 微菌叢與人類疾病(全英語) | 2 | 2 | 吳俊穎 | 陽明 生醫資訊所 | 必修 |
| 下 | 臨床細菌學 | 2 | 2 | 吳韋訥 | 陽明 醫技系(大) | 選修 |
| 下 | 醫學概論 | 2 | 2 | 郭冠良 | 陽明 生醫資訊所 | 選修 |
| 下 | 生物晶片概論 | 3 | 3 | 李博仁 | 光復 生醫工程所 | 選修 |
| 下 | 生醫設計與實作 | 3 | 3 | 陳冠宇 | 光復 生醫工程所 | 選修 |
| 下 | 奈米生醫感測 | 3 | 3 | 許鉦宗 | 光復 生醫工程所 | 必修 |
生醫資訊
| 學期 | 課程名稱 | 學分 | 時數 | 開課教師 | 校區/系所 | 選別 |
| 上 | 生物醫學資訊學基礎(一) | 2 | 2 | 黃宣誠 | 陽明 生醫資訊所 | 必修 |
| 上 | 生物網路分析 | 2 | 2 | 林振慶 | 陽明 生醫資訊所 | 選修 |
| 上 | 生醫資料探勘(全英語) | 3 | 3 | 胡毓志 | 光復 生醫工程所 | 選修 |
| 上 | 結構生物資訊 | 3 | 3 | 楊進木 | 博愛 生物科技學系 | 選修 |
| 上 | 深度學習應用 | 2 | 2 | 洪哲倫 | 陽明 生醫資訊所 | 選修 |
| 上 | 生物序列分析與高通量技術 | 3 | 3 | 陳亭妏 | 博愛 生物資訊及系統生物所 | 選修 |
| 上 | 基因體數據分析 | 2 | 2 | 鍾翊方 | 陽明 生醫資訊所 | 選修 |
| 下 | 生物醫學資訊學基礎(二) | 2 | 2 | 黃宣誠 | 陽明 生醫資訊所 | 必修 |
| 下 | 基因體信息資源與應用 | 2 | 2 | 黃彥華 | 陽明 生醫資訊所 | 選修 |
| 下 | 精準醫學新知： 基因體醫學與生醫大數據 |
1 | 1 | 柯泰名 | 博愛 生物科技學系 | 選修 |
| 下 | 量化數據分析 | 2 | 2 | 陳卓逸 | 陽明 生醫資訊所 | 必修 |